Храм в честь Архистратига Михаила на этом месте упоминается в документах 1617 г. Каменный Михаило-Архангельский храм с небольшой трапезной и шатровой колокольней был возведен ок. 1691 г. При этом прежний деревянный храм был перенесен в с. Шатово. Здание, архитектура которого характерна для храмового зодчества рубежа XVII-XVIII вв., представляет собой бесстолпный четверик со сводчатым покрытием. Возвышенный и стройный, храм гармонично соседствует с шатровой колокольней, главку которой венчает изящный кованый крест. К середине XIX в. при Михаило-Архангельском храме существовал теплый придел во имя свт. Николая. 

В 1861-1864 гг. на средства помещика князя Н.С. Вяземского и прихожан храм был перестроен, сооружены два боковых придела: правый – о имя свт. Николая, левый – в честь св. вмч. Екатерины, которые изменили облик постройки. В 1880-е гг. с. Нехорошево являлось одним из ведущих культурно-просветительских центров Московской епархии, известным не только в России, но и далеко за ее пределами.

В 1884 г. в селе было построено двухэтажное каменное здание церковно-приходской школы. А в 1896 г. она была преобразована в церковно-учительскую школу Мо1 сковской епархии. Ее попечителями состояли баронесса С.М. Энгельгардт и И.А. Хутарев. В конце XIX в. при участии семейства Хутаревых храм был обновлен и расписан. В 1937 г. Михаило-Архангельский храм с. Нехорошево был закрыт и разорен. В стенах церковноприходской школы разместилась общеобразовательная школа. 

В 1980-х гг. с. Нехорошево опустело, и в 1988 г. оно было упразднено. С этого времени храм находился в заброшенном состоянии.

Храм был возвращен Церкви в 1999 г. Алтарь и каменный свод притвора находятся в аварийном состоянии. Реставрационные работы не проводятся. Близ храма сохраняются остатки старинного кладбища – каменные надгробия XVI и XIX вв.