Николо-Кропотки – старинное село, именуемое иногда Дмитровским. В Дмитровской писцовой книге на время 1628-1629 годов записано: «За стряпчим сытного двора за Афанасием да за братом его за Дмитрием Васильевыми детьми Собакина отца с. Дмитровское и в нем церковь Николы Чудотворца древяна клецки вверх». В 7162 (1654) году Дмитрий Собакин продал село племяннику Федору, который в 7195 (1687) году продал вотчину Федору Матвеевичу Апраксину. 

В 1760 году село продано графом Петром Федоровичем Апраксиным Якову Герасимовичу Баранову. В клировой ведомости за 1789 год указаны уже две церкви: Никольская 1670 года постройки и Казанской иконы Божией Матери постройки 1789 года. Однако в межевом описании за 1855 год указана только одна деревянная церковь (прихожан 473 человек). Помещиками в это время были Барановы капитан и подпоручик, оба — Яковы Васильевичи. В селе было два деревянных господских дома. 

В конце пятидесятых годов XIX века деревянная церковь сгорела и на ее месте ставят каменную. Старожилы говорят, что церковь поставлена была на крестьянские деньги и поводом для ее постройки послужили отмена крепостного права. Существующая в настоящее время церковь была построена в 1863 году и главный престол освящен во имя Казанской иконы Божьей Матери, а два других — во имя святителя Николая и Обретения Главы Иоанна Предтечи.

Церковь оставалась действующей до начала 30-х годов XX века. В 1939 году была уничтожена церковная ограда и вся венчающая часть здания. 

После войны в церкви располагался склад совхоза «Измайловский». Утеряны верхние ярусы колокольни. 

Реставрационные работы не проводились.