Исторически село Селёвкино (c 1831 г. Селёвкино-Юрьево) находилось в Дмитровском уезде Ильинской волости (после революции Деденевской). Упоминание о селе и храме в нём мы находим в ранних письменных источниках с начала XVII века.

В писцовых книгах за 1620 г. записано: «за боярином за князем Володимером Тимофеевичем Долгоруким приданая вотчина, по жалованной грамоте 128 году, село Селевкино, на пруде; а в нем церковь Рождества Пресвятой Богородицы деревянная клетцки, в ней образы, и книги, и ризы, и колокола и всякое церковное строенье вотчинниково; в селе во дворе поп Лаврентий Матвеев, во дворе пономарь Гаврилко Сергеев прозвище Суботко; пашни церковной паханой худой земли 5 четвертей, перелогом и лесом поросло 20 четвертей в поле, а в дву потомуж, сена 10 копен; да в селе двор вотчинников, живет в нем конюх, 2 дв. крестьян и 3 дв. бобылей».

В 1720 году Богородицерождественская церковь сгорела и 19 июля 1720 запечатан указ в исходящей книге синодального Казённого приказа, по челобитной Ивана Семёновича Борятинского, о строении каменной церкви, вместо старой сгоревшей: «велено ему в вотчине тестя его, Ивана Петрова, сына Строева, <…> перевезти из села Нового, вотчины Петра Алексеевича Толстого, ветхую Покровскую церковь и построить в селе Селёвкине вновь церковь во имя Рождества Пресвятой Богородицы».

В 1740 году построена каменная церковь Рождества Пресвятой Богородицы на средства княгини Анны Федоровны Барятинской, в редком архитектурном стиле – «аннинское барокко». Этот стиль зародился в эпоху правления Петра II и Анны Иоанновны (1730–1740).

В 1941 году решением комитета московского областного совета депутатов трудящихся от 8 января под № 54 храм решено закрыть: «Учитывая, что здание церкви в с. Селёвкино-Юрьево пришло в ветхость и по заключению технической комиссии подлежит сносу — разрешить Исполкому Дмитровского Райсовета церковь в с. Селёвкино-Юрьево закрыть, а здание снести». Церковное имущество было изъято, частично разграблено. В храме разместили склад для хранения овощей и зерна, а затем склад химических удобрений. В результате этого здание церкви сильно пострадало: ядовитые испарения уничтожали своды и стены, которые начали крошиться и разрушаться. В трапезной части обвалилась кровля, и на ее территории выросли деревья.

Последним настоятелем храма являлся священник Михаил Вознесенский, который по закрытии храма был арестован. Дальнейшая судьба священника и его семьи неизвестна. 

По свидетельству местных жителей в 60-70х годах прошлого века в купол колокольни ударила молния, в результате чего купол сгорел. Колокольня без купола остается и поныне. В конце 70-х – начале 80-х годов трестом «Мособлстройреставрация» были проведены работы по частичной реконструкции храма.

Несмотря на проделанные ранее работы, в храме жгли костры, местные жители уносили кирпичи для постройки гаражей. Кровля трапезной части к концу 90-х годов обвалилась, весь придел порос бурьяном.

Разрушенный храм был передан Церкви в конце 90-х. Настоятель и первые прихожане сделали все, что могли. После расчистки и уборки храм обрел внутренние очертания, перестал казаться заброшенным. На него были водружены купол с крестом, вставлены окна и двери, основная часть была отделена от трапезной. Это позволило находиться в церкви, но богослужения здесь совершались только летом.

В 2015 году Благотворительным фондом Московской епархии по восстановлению порушенных святынь была принята благотворительная программа и выделены средства на создание и разработку проекта реставрации, а также на производство противоаварийных работ по сохранению объекта культурного наследия Богородицерождественского храма деревни Селёвкино. 

На момент начала восстановительных работ, здание храма находилось в аварийном состоянии. Своды и стены трапезной обрушены, разрушен купол колокольни, от старинной темперной росписи храма местами остался только фон и почти неразличимые лики святых.

Сегодня Богородицерождественский храм в Селевкино выглядит именно так, каким его создавали наши предки. За время восстановительных работ в храме проведены противоаварийные и реставрационные мероприятия: осуществлен комплекс мер по усилению фундамента, восстановлению кирпичной кладки цокольной части и наружных стен храма; завершены реставрационные работы по белому камню на фасаде, реставрация и усиление внутренних стен; проведены работы по устройству конструкций крыши над всем зданием храма, лестниц, перекрытий.